Doktor astronomii, zastępca dyrektora w Obserwatorium Astronomicznym Uniwersytetu Warszawskiego.
Ukończyła studia magisterskie na Uniwersytecie im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, stopień doktora uzyskała w Centrum Astronomicznym im. M. Kopernika PAN w Toruniu. Była związana naukowo z Uniwersytetem Karola w Pradze i z Uniwersytetem Wrocławskim. Jej zainteresowania naukowe skupiają się wokół tematyki gwiazd podwójnych i obiektów zwartych. Jest członkiem grupy OGLE – wielkoskalowego przeglądu nieba przy użyciu polskiego teleskopu zlokalizowanego w Chile, a także projektu Solaris mającego na celu poszukiwanie egzoplanet za pomocą sieci robotycznych teleskopów na południowej półkuli.
W 2020 roku znalazła się na liście Kobiety Roku Forbes Women. Zasiada w zarządzie Polskiego Towarzystwa Astronomicznego oraz fundacji New Space i MultiŚwiat, współtworzy studio kreatywne Science Now. W wolnych chwilach popularyzuje naukę, współpracuje z pismami popularnonaukowymi, a także redaguje książki i gry o tematyce astronomicznej.
Na 8. Śląskim Festiwalu Nauki KATOWICE dr Milena Ratajczak będzie mówiła m.in. o misji Rosetta zainicjowanej przez Europejską Agencję Kosmiczną (ESA), która była jednym z najważniejszych wydarzeń w historii badań kosmicznych. Dziesięć lat po historycznym spotkaniu z kometą 67P/Churyumov-Gerasimenko analiza danych misji wciąż dostarcza cennych informacji na temat ewolucji Układu Słonecznego.